学院创建于1959年，理工兼容，设有化学系、化工系和材料系。拥有化学、化学工程与工艺、应用化学、材料化学、制药工程5个本科专业和化学硕士学位授权一级学科；1个省级重点学科；2个省级重点实验室；1个省级实验教学示范中心；1个省级特色专业；1个山东省名校工程重点建设专业；3门省级精品课程；1门省级双语教学示范课程；2个学校热门专业；1个校级特色专业；2个校级优秀教学团队；1个济宁市优秀科技创新团队；1个“泰山学者”科研创新团队；1个校级科研创新团队；1个校企共建中试实验室。
学院师资力量雄厚。现有教授12人（泰山学者1人），副教授21人，博士生导师2人，硕士生导师23人，博士43人。近年来，承担国家基金20余项，省部级科研项目40余项，其它课题60余项，每年发表SCI论文50余篇，30余项科研成果获得厅级以上奖励，1人获高校微课教学比赛全国决赛三等奖，获国家发明专利9项，实现科技成果转化6项，取得较大经济社会效益。
学院实验室面积1.8万平米，仪器设备总值4400余万元。加强学生基础知识的学习和基本技能的培养是学院的传统，重视提高学生的创新意识、创新能力和综合素质是学院的特色，每年级本科生都能成功申请到多项国家级大学生创新创业项目，近几来，学生获省级以上各类奖励100余项，平均考研率在50%以上。
50多年来，为社会输送近7000名合格毕业生，很多人已成为国内化学领域的领军人物，更有多人获得山东省专业教学能手、优秀教师、齐鲁名师等荣誉称号，赢得了社会的广泛好评。中国科学院上海生物化学研究所王恩多院士就是化学院的优秀毕业生代表。
化学
学科优势：化学专业属师范类专业，拥有化学学科硕士学位授权一级学科、化学教学论硕士学位授权点和教育硕士学位授权点。山东省重点建设专业，2009年被评为山东省特色专业，曲阜师范大学热门专业。高质量的教师教育；“产学研”紧密结合、学生综合素质高；高水平的社会服务能力；考研与就业率高。
就业方向：中等学校化学师资、化学相关的企事业单位工作人员、公司研发人员、攻读研究生。
主干课程：高等数学、无机化学（含实验）、分析化学（含实验）、有机化学（含实验）、物理化学（含实验）、仪器分析（含实验）、化学教学论、中学化学实验教学研究、化工基础（含实验）。
化学工程与工艺
学科优势：本专业设有煤化工、安全工程、环保化工和工业催化4个专业方向，属工科专业，山东省名校工程财政资助重点建设专业，曲阜师范大学热门专业。工程设计和实施能力强、职业素质优良；“产学研”紧密结合、学生综合素质高，本科生承担多项国家级科研训练计划项目；高水平的社会服务能力；考研与就业率高。
就业方向：化学化工相关的企事业单位工作人员、公司研发人员、攻读研究生。
主干课程：高等数学、有机化学（含实验)）、分析化学（含实验）、物理化学（含实验）、仪器分析（含实验）、化工原理（含实验）、化工制图、化工热力学、化学工艺学、化学反应工程、化工过程分析与合成、化工设计、化工仪表及自动化、专业实验等。
应用化学
学科优势：本专业设有精细化工和工业分析两个专业方向，属工科专业，现为学校应用型重点建设专业。应用开发和实践能力强、职业素质优良；“产学研”紧密结合、学生综合素质高；高水平的社会服务能力；考研与就业率高。
就业方向：化学化工相关的企事业单位工作人员、公司研发人员、攻读研究生。
毕业生具有较强的适应能力和较广泛的选择范围。
主干课程：高等数学、有机化学（含实验)）、分析化学（含实验）、物理化学（含实验）、仪器分析（含实验）、化工原理（含实验）、化工制图、化工仪表及自动化、化学工艺学、精细有机合成及工艺学、工业分析与质检、专业实验等。
材料化学
学科优势：本专业属理工兼容型专业，设有高分子材料和无机材料两个专业方向，曲阜师范大学特色专业。雄厚的基础教育与研究、职业素质优良；“产学研”紧密结合、学生综合素质高；高水平的社会服务能力；考研与就业率高。
就业方向：化工及材料科学领域相关的企事业单位工作人员、公司研发人员、攻读研究生。
主干课程：高等数学、有机化学（含实验)）、分析化学（含实验）、物理化学（含实验）、仪器分析（含实验）、化工原理（含实验）、化工制图、材料科学基础、高分子化学、无机非金属材料、材料研究方法、复合材料、高分子材料成型加工、纳米材料与技术、材料化学、专业实验等。
制药工程
学科优势：本专业设有药学与工艺、工程与设备两个专业方向，属工科专业，学校新上重点建设专业。雄厚的基础教育与研究；“产学研”紧密结合；高水平的社会服务能力。
就业方向：精细化工及制药领域相关的企事业单位工作人员、公司研发人员、攻读研究生。
主干课程：高等数学、有机化学（含实验)）、分析化学（含实验）、物理化学（含实验）、仪器分析（含实验）、化工原理（含实验）、化工制图、化学反应工程、药物化学、药物分析、药物及中间体合成、制药设备与工程设计、制药工艺学、天然药物化学、药理学、药剂学专业.
